私の場合、
・マイリス:とにかく作ったもの参加したもの全部(他の方がうpしたものも含めて)突っ込む
https://www.nicovideo.jp/mylist/29268827
・シリーズ:自分がうpした動画を用途ごとに分ける
ボカロオリジナル曲 https://www.nicovideo.jp/series/3348
ボカロカバー曲(ボカロ曲・NNI等) https://www.nicovideo.jp/series/4450
ボカロカバー曲(J-POP・アニソン等) https://www.nicovideo.jp/series/4500
で使い分けてます。