@tomoki プロジェクトというか、データベースの中にプロジェクトが格納されるので、それをどこに置く設定にしているか…だったと思います。
(一旦はCドライブに保存されるはずです)
ただ、ストレージ圧迫に関係するキャッシュなどのファイルは設定で個別にディレクトリを指定できるので、DBファイル自体は大したサイズにならず、利便性を考慮するとCドライブでも問題ないのかな…と思っていたりはします。
https://detail.chiebukuro.yahoo.co.jp/qa/question_detail/q14257591854